Podpora SEO v 2.8.0 síce je, ale treba ju zapnúť na úrovni Layoutu - vo FreeStyle je defaultne zapnutá, ale vo Freestyle2006 nie je. Dôvod je ten, že SEO odkazy tak aby boli zapnuté všade, treba zmeniť aj v zdrojákoch search.php. Tiež by som odporučil doplniť presmerovanie pomocou funkcie header ak je SEO link odkazu získaného z GET (GLOBALS) nerovný SEO linku generovaného v phpRS.
Inak pre SOE linky je pripravená metóda triedy clanek: $GLOBALS["clanek"]->Ukaz("link_seo")
Je tu jeden veľmi dobrý thread ohľadne SEO aj s návodmi. Odporúčam vyhľadať a prečítať.